More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1662 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 478 aa  987    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 486 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  65.09 
 
 		 484 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 		 489 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 486 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  64.68 
 
 		 484 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 494 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 486 aa  611  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 499 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1967  cysteinyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 		 493 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 511 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 500 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 492 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 489 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 460 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 481 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 493 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 472 aa  428  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 474 aa  428  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  47.49 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 479 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 487 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 447 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 476 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5384  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706062  normal  0.64461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5999  cysteinyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2113  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2078  cysteinyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1983  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746601  normal  0.57879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>