More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2722 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 486 aa  1013    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  78.81 
 
 		 484 aa  809    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 		 486 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  62.58 
 
 		 494 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  69.12 
 
 		 486 aa  712    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 478 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  64.63 
 
 		 489 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  78.4 
 
 		 484 aa  806    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 499 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 511 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1967  cysteinyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 493 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 500 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 492 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 489 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 493 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 465 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 465 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 465 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 465 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 465 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 484 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 481 aa  448  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 479 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 468 aa  451  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 470 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 455 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 465 aa  445  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 486 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 487 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  48.5 
 
 		 485 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 488 aa  433  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 476 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1349  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 488 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 478 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 478 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 465 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>