More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_13301 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  94.48 
 
 		 489 aa  957    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  79.07 
 
 		 492 aa  818    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  95.09 
 
 		 489 aa  961    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 489 aa  1006    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 516 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 499 aa  552  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 511 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1967  cysteinyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 489 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 486 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 484 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 486 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 487 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  39.41 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 465 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 488 aa  363  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  41.2 
 
 		 497 aa  363  4e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 472 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 485 aa  362  9e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>