More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_15891 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  96.8 
 
 
500 aa  992    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
500 aa  1026    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
516 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
499 aa  591  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
511 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1967  cysteinyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
493 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
486 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
492 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
489 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
478 aa  511  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
489 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
494 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
486 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
486 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
493 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
481 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
487 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
472 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
468 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
493 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
494 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
481 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
465 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
466 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
466 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
466 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
480 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
485 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
484 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
485 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
500 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
479 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
485 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
480 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
485 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
470 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
468 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
466 aa  385  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
488 aa  382  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
486 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
457 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
459 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
466 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
458 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
461 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  42.02 
 
 
485 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
448 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
490 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
461 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
465 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
465 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
456 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
457 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
465 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
466 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
487 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
466 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
459 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
466 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
474 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
465 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
478 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
447 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
465 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
465 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
465 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
456 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
474 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
465 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
465 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
483 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
459 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
461 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
478 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
459 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
476 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
485 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
478 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
463 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
464 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
466 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
470 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  41.3 
 
 
497 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
461 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
505 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
460 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
461 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
477 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
460 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
447 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
461 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
459 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
468 aa  365  1e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
459 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
459 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>