More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3108 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
466 aa  961    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  62.58 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
478 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 
478 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 
458 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 
457 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
457 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
453 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
476 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
461 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
476 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
487 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
474 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
476 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 
461 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
500 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
470 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
485 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
466 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 
481 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
460 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
459 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
460 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
460 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
484 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
465 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
460 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
460 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
468 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
486 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
480 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
460 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
460 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
461 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
487 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
485 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
465 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
485 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
460 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
459 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
460 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
458 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
465 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
470 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
460 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
460 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
488 aa  412  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
494 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
485 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
466 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
466 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
481 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
466 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
459 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
466 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
466 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
485 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
465 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
459 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
468 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
479 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
465 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
469 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
461 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
485 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
461 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
486 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>