More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0398 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
477 aa  987    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 
486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 
476 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
478 aa  531  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 
468 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
474 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 
487 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
485 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
481 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
494 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
466 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 
466 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
493 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
466 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
480 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
468 aa  485  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
465 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
465 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
465 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
465 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
465 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
465 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
465 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
470 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
466 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
465 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
465 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
465 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
478 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
478 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
481 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
470 aa  461  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
490 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
466 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
459 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
487 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
461 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
461 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
460 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
474 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
461 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
459 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
476 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
469 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
461 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
459 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
461 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
461 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
461 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
466 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
476 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
460 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
458 aa  443  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
459 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
498 aa  443  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
459 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
457 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
461 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
455 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
459 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
485 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
455 aa  435  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
462 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
460 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
463 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
465 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>