More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0061 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 458 aa  946    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  91.67 
 
 		 457 aa  876    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  94.96 
 
 		 457 aa  900    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 466 aa  491  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 484 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 500 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 477 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 488 aa  428  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 465 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 468 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 487 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 470 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  46.19 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 486 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 462 aa  408  1e-113  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 479 aa  408  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>