More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3508 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  82.61 
 
 
460 aa  802    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  82.39 
 
 
460 aa  800    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  82.39 
 
 
460 aa  799    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  82.17 
 
 
460 aa  800    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  82.83 
 
 
460 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
460 aa  955    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  82.17 
 
 
460 aa  795    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  83.04 
 
 
460 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  82.14 
 
 
461 aa  755    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  98.91 
 
 
460 aa  944    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  82.57 
 
 
461 aa  795    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  66.3 
 
 
461 aa  631  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  63.97 
 
 
460 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
463 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 
465 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 
460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 
459 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 
461 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  61 
 
 
455 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  60.87 
 
 
485 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  59.69 
 
 
461 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 
505 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 
458 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 
460 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
461 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
456 aa  558  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
461 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 
459 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
459 aa  558  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
461 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 
456 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 
461 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
462 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
459 aa  552  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
456 aa  551  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
461 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
461 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
461 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
461 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
465 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  59.61 
 
 
459 aa  549  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 
461 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 
461 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
461 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
461 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
461 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
461 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 
459 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  59.48 
 
 
461 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 
459 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  55.07 
 
 
485 aa  545  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 
459 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
461 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
459 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
461 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 
461 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
459 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
461 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
461 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 
459 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
454 aa  541  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
461 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
461 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
459 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
461 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 
459 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
459 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
488 aa  537  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
460 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 
461 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
488 aa  533  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3046  cysteinyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 
461 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
461 aa  533  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
464 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
481 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
456 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  57.57 
 
 
462 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
463 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 
463 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 
465 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 
485 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 
465 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
480 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
469 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 
462 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5384  cysteinyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706062  normal  0.64461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 
462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5999  cysteinyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1875  cysteinyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 
462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000229747  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2078  cysteinyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>