More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12151 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 499 aa  698    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 		 511 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 516 aa  1080    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1967  cysteinyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 500 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 492 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 489 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 494 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 486 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 486 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 465 aa  428  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 485 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 487 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 485 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 481 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 461 aa  392  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 456 aa  389  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 474 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  42.64 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1670  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 470 aa  372  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 455 aa  372  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 472 aa  372  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>