More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0086 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  74.35 
 
 
465 aa  749    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 
465 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  73.71 
 
 
465 aa  747    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 
465 aa  748    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 
465 aa  748    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 
465 aa  748    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
466 aa  964    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 
465 aa  748    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  90.34 
 
 
466 aa  865    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 
465 aa  748    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  74.35 
 
 
465 aa  748    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  73.92 
 
 
465 aa  723    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  73.71 
 
 
465 aa  723    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  64.38 
 
 
466 aa  634  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 
466 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 
466 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
470 aa  587  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 
468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
465 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 
466 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
466 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
472 aa  549  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
470 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
468 aa  543  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
474 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
469 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
447 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
474 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
447 aa  512  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
500 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
476 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
472 aa  496  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
478 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
481 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 
448 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
493 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
481 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
485 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
487 aa  490  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
486 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
484 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
484 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
486 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
484 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
478 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
480 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
485 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
467 aa  480  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
493 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
478 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
486 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
480 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
489 aa  476  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
487 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
465 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
477 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
486 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
461 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
460 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
472 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
464 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
470 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
485 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
456 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
465 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
460 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
463 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
460 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
459 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
485 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
457 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
460 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1875  cysteinyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
462 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000229747  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
460 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
457 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
462 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
499 aa  444  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
458 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
456 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  46.44 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>