More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1589 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
487 aa  999    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 
488 aa  586  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
481 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
485 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
466 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
465 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
474 aa  482  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
466 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
466 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
478 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
468 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
500 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
478 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
480 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
494 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
466 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
480 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
481 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
485 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
486 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
465 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
465 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
465 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
466 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
465 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
487 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
459 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
472 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
485 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
460 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
465 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
470 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
485 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
476 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
460 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
465 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
460 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
460 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
466 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
461 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
460 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
460 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
483 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
470 aa  432  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  46 
 
 
458 aa  433  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
459 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
484 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
460 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
464 aa  435  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
460 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
459 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
459 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
461 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
484 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
455 aa  434  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
461 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
461 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
474 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
475 aa  435  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
469 aa  433  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
461 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
460 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
493 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
457 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
455 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
460 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
490 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
459 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
459 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
459 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
459 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
470 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
461 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>