More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1447 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  68.8 
 
 		 485 aa  688    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  68.18 
 
 		 485 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 483 aa  1001    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  67.36 
 
 		 485 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 		 485 aa  672    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 		 485 aa  618  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 493 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 487 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 481 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 459 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 461 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 470 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 481 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 459 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  46.63 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 485 aa  435  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 488 aa  428  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  47.11 
 
 		 497 aa  428  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 460 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>