More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2121 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 
485 aa  676    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  65.5 
 
 
485 aa  694    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  73.14 
 
 
485 aa  756    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  72.73 
 
 
485 aa  768    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
485 aa  1009    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  67.36 
 
 
483 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
481 aa  535  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
481 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
493 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
487 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
485 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
480 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
494 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
479 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
465 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
461 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
474 aa  467  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
460 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
459 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
470 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
500 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
488 aa  455  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
459 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  47.96 
 
 
485 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
455 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
488 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
485 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
461 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
486 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
481 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
468 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 
456 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
459 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
481 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
481 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
484 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
461 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
461 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
490 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
478 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
463 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
476 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
468 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
459 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
460 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
466 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
460 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
482 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
466 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
505 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
465 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
460 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
469 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
456 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  47.86 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
461 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
459 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
459 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
460 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
465 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
461 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
461 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
476 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
460 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6809  cysteinyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
495 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
476 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
458 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
459 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
465 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
465 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
465 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
461 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
465 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
460 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
460 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
460 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
459 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
461 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>