More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1634 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1015    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 
493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 
485 aa  568  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
494 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
487 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
480 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
479 aa  554  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
481 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
480 aa  549  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 
485 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
485 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
485 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
485 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
460 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
465 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  49.7 
 
 
485 aa  498  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
483 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
455 aa  498  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
468 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
490 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
466 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
461 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
459 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
459 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
459 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
461 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
461 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
459 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
461 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
461 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
500 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
459 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
454 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
464 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
485 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
459 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
485 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
465 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
460 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
460 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
466 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
465 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
466 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
466 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
474 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
465 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
465 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
460 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
460 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
460 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
460 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
460 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
465 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
486 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
459 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
461 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
460 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
465 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
465 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
465 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
456 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
460 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
461 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
465 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
459 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
466 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
465 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
459 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
460 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
505 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
459 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
460 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
460 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
456 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
459 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
461 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 
458 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
461 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
461 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
486 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  47.88 
 
 
497 aa  462  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
456 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
465 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
462 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
459 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
484 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>