More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1967 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  72.29 
 
 		 499 aa  707    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1967  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 493 aa  1008    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  68.81 
 
 		 511 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 516 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 		 478 aa  578  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 484 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 		 484 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 494 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 486 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 489 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 489 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 492 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 489 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 472 aa  412  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 490 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 480 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 480 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 470 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  45.11 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 486 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 488 aa  382  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 478 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 474 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 456 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1670  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>