More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1109 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
488 aa  1001    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
481 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
478 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
493 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
478 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
485 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
486 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
494 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
478 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
481 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
465 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
487 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
479 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
474 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
466 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
466 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
466 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
466 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
493 aa  432  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
468 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
480 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
458 aa  428  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
457 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
480 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
455 aa  426  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
485 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
477 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
468 aa  425  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
483 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
485 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
470 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
465 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
456 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
465 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
472 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
465 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
456 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
466 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
485 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
490 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
457 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
485 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
476 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
459 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
465 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
466 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
476 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
486 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
460 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
485 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
488 aa  409  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  42.74 
 
 
485 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 
484 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
459 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
460 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
465 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
488 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
465 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
469 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
461 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
478 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
459 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
454 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
461 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
461 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
460 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
485 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
493 aa  399  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
455 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
461 aa  402  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
460 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
460 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
458 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
460 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
460 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>