More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0162 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 468 aa  974    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 467 aa  625  1e-178  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 472 aa  528  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 465 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 447 aa  477  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 466 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 476 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 485 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 489 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 487 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  42.17 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>