More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0534 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  94.75 
 
 
476 aa  922    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
476 aa  970    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  71.64 
 
 
475 aa  710    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  94.12 
 
 
476 aa  920    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 
479 aa  557  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
468 aa  472  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
466 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
481 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
459 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
465 aa  448  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
500 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
459 aa  441  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
465 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
468 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
459 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
480 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
494 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
465 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
493 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
458 aa  435  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
462 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
465 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
485 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
470 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
466 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
459 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
490 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
459 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
465 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
465 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
461 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
457 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
493 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
466 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
457 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
485 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
485 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
459 aa  431  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
461 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
485 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
465 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
459 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
456 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
460 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
485 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
461 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
455 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
466 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
461 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
456 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
461 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
461 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
470 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
459 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
459 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
459 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
458 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
464 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
461 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
461 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
479 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
493 aa  424  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
459 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
459 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
466 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
461 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  43.46 
 
 
485 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
460 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
481 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
466 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
460 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
461 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
461 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
459 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
460 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
469 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
455 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
488 aa  417  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>