More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1644 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 472 aa  966    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 485 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 466 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 466 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 493 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 459 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 466 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 487 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 459 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 461 aa  362  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 492 aa  362  8e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 466 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 466 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 468 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 459 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 461 aa  353  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 447 aa  353  4e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 485 aa  352  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 486 aa  352  8e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 481 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 485 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 484 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 477 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  42.32 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 485 aa  349  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 465 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 456 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 447 aa  346  5e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 486 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 476 aa  345  7e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>