More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1031 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1031  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
471 aa  981    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
475 aa  369  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
472 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
465 aa  349  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
456 aa  346  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
456 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
471 aa  343  5e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
495 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
485 aa  339  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
460 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
468 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
466 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
460 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
459 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
447 aa  320  3e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
498 aa  319  7e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
459 aa  319  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
460 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
460 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
461 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
460 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
461 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
461 aa  317  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
461 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
465 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
461 aa  316  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
460 aa  315  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
461 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
459 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
460 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
460 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
459 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
461 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
459 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
459 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
459 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
459 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
459 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
468 aa  310  4e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
459 aa  310  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
462 aa  307  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
501 aa  306  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
465 aa  306  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  37 
 
 
493 aa  303  3.0000000000000004e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
458 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
461 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
465 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
465 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
465 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
465 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
465 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
465 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
467 aa  302  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
461 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
461 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
465 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
461 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
461 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  38.56 
 
 
461 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
465 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
460 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
461 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
460 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
461 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
461 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
456 aa  300  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
453 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
466 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
461 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
465 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
464 aa  299  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
459 aa  299  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
461 aa  299  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
460 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>