More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0583 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  94.58 
 
 
461 aa  888    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  94.36 
 
 
461 aa  887    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  71.15 
 
 
459 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  82.21 
 
 
461 aa  808    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  69.85 
 
 
459 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  83.08 
 
 
461 aa  790    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  82.21 
 
 
461 aa  809    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  70.93 
 
 
459 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  82.43 
 
 
461 aa  819    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  82.21 
 
 
461 aa  808    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  75.7 
 
 
460 aa  741    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  82.65 
 
 
461 aa  797    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  71.15 
 
 
459 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 
459 aa  692    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  69.63 
 
 
461 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
461 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  71.37 
 
 
459 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  83.73 
 
 
461 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  94.79 
 
 
461 aa  890    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  94.58 
 
 
461 aa  888    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  94.58 
 
 
461 aa  888    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  71.37 
 
 
459 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  74.51 
 
 
462 aa  734    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  99.78 
 
 
461 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  67.46 
 
 
459 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  66.3 
 
 
462 aa  668    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  94.58 
 
 
461 aa  888    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  94.36 
 
 
461 aa  886    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  74.35 
 
 
459 aa  740    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  74.4 
 
 
459 aa  732    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  71.37 
 
 
461 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  71.37 
 
 
461 aa  707    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  69.91 
 
 
460 aa  698    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  94.58 
 
 
461 aa  888    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  99.78 
 
 
461 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  68.55 
 
 
459 aa  685    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  90.02 
 
 
465 aa  864    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  99.78 
 
 
461 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  75.92 
 
 
460 aa  740    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  99.78 
 
 
461 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  71.15 
 
 
461 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  83.3 
 
 
461 aa  810    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  70.72 
 
 
459 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 
459 aa  698    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 
461 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  94.58 
 
 
461 aa  887    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  62.34 
 
 
469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 
460 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  63.79 
 
 
464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 
485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 
460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 
461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  60.35 
 
 
460 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 
460 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  58.71 
 
 
465 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
460 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
460 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
460 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 
459 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 
460 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  60.92 
 
 
461 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 
456 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 
461 aa  548  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 
460 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  59 
 
 
455 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
460 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 
463 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
456 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 
456 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 
460 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 
454 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
458 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
460 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  54.55 
 
 
485 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 
463 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
505 aa  524  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
473 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
473 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
462 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
456 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3046  cysteinyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 
461 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
488 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 
465 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
463 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
464 aa  500  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
462 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
462 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1875  cysteinyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
462 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000229747  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
481 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
488 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 
465 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1085  cysteinyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 
491 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189428  normal  0.0293604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
465 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1167  cysteinyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103302  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
485 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
454 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
493 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
487 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>