More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2485 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
457 aa  946    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1031  cysteinyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
471 aa  462  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
475 aa  360  3e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
495 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
468 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
468 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
459 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
459 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
489 aa  325  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
459 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
461 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
461 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
461 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
485 aa  322  8e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
470 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
459 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
461 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
459 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
453 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
459 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
461 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
449 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
460 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
462 aa  318  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
505 aa  318  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
485 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
481 aa  316  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
459 aa  315  8e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
785 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0386515 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
461 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
449 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
447 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
461 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  44.12 
 
 
461 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
461 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
461 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
461 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
461 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
461 aa  312  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
461 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
461 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
461 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
456 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
461 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
459 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
461 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
461 aa  312  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
473 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
464 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
461 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
478 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
466 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
466 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
466 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
486 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
459 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
458 aa  309  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  41.86 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
470 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
478 aa  307  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
461 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
460 aa  307  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
486 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
485 aa  306  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
465 aa  306  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
493 aa  306  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
461 aa  306  7e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
461 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
462 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
461 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
478 aa  306  7e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>