More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1404 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 449 aa  909    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 453 aa  578  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  60.87 
 
 		 459 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 472 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 		 458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 486 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 486 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 461 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 459 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 459 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 459 aa  435  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 463 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 456 aa  425  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 482 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 488 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 506 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  50 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 460 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 460 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>