More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2398 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 461 aa  947    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  59.83 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 459 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 459 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 457 aa  435  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 461 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 461 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 461 aa  418  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 461 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 500 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 459 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 456 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 461 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>