More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2722 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 499 aa  1019    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  86.89 
 
 		 486 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  71.88 
 
 		 486 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  78.09 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 458 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  69.15 
 
 		 457 aa  541  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  66.94 
 
 		 453 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 493 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2086  cysteinyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.634388  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0481  cysteinyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1038  cysteinyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 472 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0677  cysteinyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0670  cysteinyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 474 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 458 aa  352  7e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 459 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 468 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 461 aa  332  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 465 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 465 aa  329  7e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 459 aa  329  8e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2456  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 486 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 485 aa  326  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  48.34 
 
 		 497 aa  326  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 460 aa  326  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 461 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 461 aa  323  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 459 aa  323  6e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 461 aa  322  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3046  cysteinyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 461 aa  322  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 461 aa  322  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 461 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  47.2 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>