More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0590 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
470 aa  966    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  73.46 
 
 
462 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  75.86 
 
 
465 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
457 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 
460 aa  463  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
461 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
493 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
492 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
510 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
785 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
527 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
480 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
483 aa  317  3e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
484 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
457 aa  307  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
481 aa  306  7e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
481 aa  302  9e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
475 aa  300  3e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
466 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
454 aa  296  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
459 aa  294  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
497 aa  294  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
459 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
469 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
497 aa  293  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
459 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
494 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  42.21 
 
 
459 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
465 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  38 
 
 
484 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
459 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
459 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
495 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
472 aa  290  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  36.79 
 
 
495 aa  290  4e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
460 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
466 aa  289  6e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
459 aa  289  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
459 aa  289  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
466 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
466 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
455 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
460 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
461 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
459 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
461 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
504 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
462 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
468 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
459 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
461 aa  286  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
470 aa  286  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  40.59 
 
 
461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
459 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
468 aa  283  5.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
481 aa  283  6.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
459 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
461 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
461 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
481 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
461 aa  282  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
470 aa  282  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
465 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
456 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
448 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
461 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
472 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
499 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
465 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
492 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>