More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1818 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  71.61 
 
 		 483 aa  736    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 480 aa  1005    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  73.44 
 
 		 484 aa  750    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  68.88 
 
 		 484 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  71.1 
 
 		 484 aa  742    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  67.71 
 
 		 481 aa  696    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  68.81 
 
 		 484 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 497 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  44.53 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 494 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 486 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 460 aa  392  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 485 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 456 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 465 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2320  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0745379  hitchhiker  0.000096837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>