More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1878 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 490 aa  1025    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 486 aa  598  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 495 aa  596  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 497 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 492 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 492 aa  567  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  52.21 
 
 		 495 aa  543  1e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 500 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 480 aa  488  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 481 aa  448  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 497 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 487 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 485 aa  356  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 479 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 468 aa  352  7e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 493 aa  349  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 459 aa  349  8e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 480 aa  349  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 494 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 476 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 460 aa  347  4e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 461 aa  345  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 461 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 461 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 455 aa  343  4e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 487 aa  343  5e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 458 aa  340  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 456 aa  340  5e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 456 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 494 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 478 aa  339  8e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0170  cysteinyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 459 aa  333  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 461 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 461 aa  333  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 473 aa  332  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 485 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 459 aa  332  8e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>