More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0973 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 463 aa  935    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  70.59 
 
 		 469 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  75.43 
 
 		 465 aa  696    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 459 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  71.99 
 
 		 481 aa  675    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  72.45 
 
 		 467 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  71.77 
 
 		 481 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  71.99 
 
 		 481 aa  675    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  72.21 
 
 		 463 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 467 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 466 aa  551  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 473 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  56.68 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 464 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 477 aa  498  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 480 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 481 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 480 aa  485  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 488 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 485 aa  468  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 487 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  44.91 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 549 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 506 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 474 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 461 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 481 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 493 aa  362  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 468 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 459 aa  359  4e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 470 aa  360  4e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 498 aa  360  4e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 468 aa  359  7e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 486 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 456 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 485 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 478 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 462 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 466 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 485 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>