More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0730 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 485 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  78.44 
 
 		 488 aa  759    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 487 aa  997    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 471 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 467 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  50.61 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  44.83 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 481 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 461 aa  362  8e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 485 aa  360  4e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 460 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 460 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 494 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 459 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 466 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 468 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 481 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 462 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 498 aa  350  3e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 480 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 479 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 487 aa  349  6e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 505 aa  349  8e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 485 aa  349  8e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 465 aa  346  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 478 aa  346  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 493 aa  346  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>