More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0654 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 467 aa  941    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  65.74 
 
 		 467 aa  624  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  65.67 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 465 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 471 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 464 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 463 aa  574  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 		 471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 459 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 464 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  60.89 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 481 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 465 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 		 480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 524 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  46.04 
 
 		 588 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 487 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 485 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  43.65 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 456 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1349  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 470 aa  363  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>