More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2664 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 451 aa  908    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 466 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 467 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 459 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  54.99 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 463 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 473 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 471 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 481 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 487 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 481 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 549 aa  339  5e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 461 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 461 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 459 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  40.52 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 487 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 459 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 459 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 498 aa  330  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 461 aa  328  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 459 aa  323  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 497 aa  322  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 455 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 501 aa  319  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 481 aa  319  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 487 aa  318  9e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  42.57 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 460 aa  316  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 465 aa  315  8e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 461 aa  315  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 479 aa  315  9e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  42.78 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 463 aa  312  6.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 460 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 465 aa  310  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>