More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0360 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  67.6 
 
 		 459 aa  666    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 464 aa  947    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 465 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 467 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 467 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  60.52 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  59.05 
 
 		 465 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 465 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 		 471 aa  521  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 464 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 469 aa  521  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 480 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 480 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 488 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 487 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 451 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 549 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  43.67 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 481 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 487 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 459 aa  364  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 463 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 481 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 485 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 456 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 474 aa  355  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 477 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 459 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 459 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 459 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  40.95 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 463 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 460 aa  347  4e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 461 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 505 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>