More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4659 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  92.99 
 
 
471 aa  878    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
471 aa  958    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 
480 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 
467 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 
467 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
465 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  60.64 
 
 
465 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
471 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 
471 aa  534  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 
464 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 
466 aa  528  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 
470 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
474 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 
469 aa  501  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
459 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
500 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
481 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 
477 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
481 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
481 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
465 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
469 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
485 aa  483  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
469 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 
480 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 
487 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 
463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 
481 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
473 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
549 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
506 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  42.7 
 
 
588 aa  416  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
481 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
459 aa  362  8e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
461 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
459 aa  360  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
459 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
461 aa  356  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
459 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
461 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
459 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
459 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
461 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
459 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
459 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
493 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
474 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
485 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
468 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
456 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
494 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
486 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
493 aa  347  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
456 aa  345  8e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
484 aa  345  8e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
480 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
485 aa  345  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
480 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
461 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
459 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
501 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
460 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
487 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
477 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
459 aa  343  5e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
460 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
481 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
458 aa  341  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
498 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
461 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
461 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
460 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
485 aa  339  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
474 aa  336  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
460 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
460 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
460 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
461 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
460 aa  334  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
461 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>