More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0780 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 474 aa  954    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  65.34 
 
 		 477 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 		 480 aa  578  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 469 aa  574  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  60.89 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 471 aa  535  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 465 aa  534  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 463 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  57.81 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 459 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 465 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  45.45 
 
 		 588 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 506 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 456 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 479 aa  361  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 480 aa  359  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 461 aa  359  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 485 aa  358  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 493 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 485 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 488 aa  356  5.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 459 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 459 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 487 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 487 aa  352  8.999999999999999e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 459 aa  347  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 505 aa  345  7e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 460 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>