More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0911 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 471 aa  943    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  62 
 
 		 465 aa  571  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 471 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 467 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  62.92 
 
 		 480 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 500 aa  554  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 464 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 471 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  58.3 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 465 aa  531  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 487 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 481 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 481 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 480 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 469 aa  505  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 473 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  49.72 
 
 		 588 aa  499  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 506 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 524 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  45.81 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 505 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>