More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4737 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  88.22 
 
 		 467 aa  810    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  80.79 
 
 		 469 aa  796    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  99.79 
 
 		 481 aa  975    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  71.99 
 
 		 463 aa  671    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  976    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  976    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  90.93 
 
 		 463 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  68.56 
 
 		 465 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 466 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 473 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 471 aa  508  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 464 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  55.31 
 
 		 465 aa  494  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 465 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 471 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 488 aa  458  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  44.07 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 480 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 485 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 493 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 458 aa  362  8e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 485 aa  362  9e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 479 aa  362  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 498 aa  361  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 465 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 486 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  40.57 
 
 		 485 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 474 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 463 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 477 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 488 aa  356  5.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 461 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 505 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 465 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 460 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 460 aa  349  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 485 aa  349  5e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 461 aa  348  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 487 aa  348  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6809  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 459 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 459 aa  346  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 468 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>