More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1011    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 471 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 485 aa  531  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 477 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 487 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  55.42 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 464 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 469 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 480 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 465 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 549 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  46.04 
 
 		 588 aa  441  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 473 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 493 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 485 aa  362  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 487 aa  360  4e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 455 aa  360  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 485 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 494 aa  359  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 461 aa  359  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 461 aa  359  7e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 474 aa  356  6.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 480 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 461 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 480 aa  352  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 473 aa  352  8.999999999999999e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 461 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 463 aa  350  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 459 aa  349  7e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 461 aa  349  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 454 aa  348  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 468 aa  346  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 460 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 461 aa  346  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 461 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>