More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5552 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  72.69 
 
 
500 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
499 aa  1045    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 
497 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  53.23 
 
 
495 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 
499 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
486 aa  548  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
492 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
492 aa  542  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
490 aa  523  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
495 aa  523  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
484 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
481 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
484 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
481 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
497 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
480 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
500 aa  358  9e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
487 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
486 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
488 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
493 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
472 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
484 aa  336  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
488 aa  336  7e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
487 aa  335  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
461 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
481 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
466 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
481 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
490 aa  333  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
477 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
474 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
478 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
476 aa  329  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
488 aa  326  5e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
476 aa  327  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
494 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
460 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
466 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
493 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
480 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
465 aa  323  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
465 aa  322  8e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
474 aa  322  8e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
465 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
485 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
465 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
785 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
492 aa  317  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
468 aa  317  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
456 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
461 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
466 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
498 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
465 aa  317  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
485 aa  317  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
461 aa  317  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
485 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
461 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
461 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
479 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
463 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
472 aa  310  4e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
460 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
465 aa  310  5e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
500 aa  309  8e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
459 aa  309  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 
500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>