More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1693 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 465 aa  962    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 460 aa  511  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 457 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 785 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 480 aa  375  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 483 aa  363  4e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 484 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 469 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 472 aa  352  8e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 466 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 474 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 497 aa  349  7e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 484 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 493 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 468 aa  342  8e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  38.41 
 
 		 495 aa  342  8e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 494 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 486 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 500 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 456 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 485 aa  336  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 466 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 477 aa  333  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  40.96 
 
 		 459 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 476 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 493 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 490 aa  329  5.0000000000000004e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 461 aa  329  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 500 aa  329  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 467 aa  328  9e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 472 aa  326  5e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 486 aa  326  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 486 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 478 aa  326  7e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 504 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 453 aa  322  7e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 470 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 461 aa  320  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 484 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 459 aa  317  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 459 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 499 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>