More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0807 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
504 aa  1038    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
484 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
484 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
483 aa  359  8e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
480 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
468 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
495 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
484 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
461 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
481 aa  347  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
481 aa  346  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
481 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
493 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
472 aa  340  4e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
465 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
470 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
466 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
487 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
453 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
468 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
481 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
472 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
485 aa  326  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
785 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
484 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
485 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
470 aa  322  8e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
474 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
459 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
456 aa  320  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
460 aa  320  5e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
460 aa  319  7.999999999999999e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
458 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
474 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
466 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
490 aa  317  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
466 aa  316  7e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
492 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  37 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
474 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
457 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  41.38 
 
 
459 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
486 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
465 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
500 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
469 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
493 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
465 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
465 aa  310  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
486 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
478 aa  310  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
489 aa  309  5.9999999999999995e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
471 aa  309  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
485 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
470 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
480 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
475 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
492 aa  303  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
483 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
457 aa  303  7.000000000000001e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  37.84 
 
 
485 aa  302  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
476 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
462 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
482 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
488 aa  301  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
464 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
492 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
455 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
459 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
478 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
485 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>