More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1805 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  78.08 
 
 		 481 aa  767    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  987    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 		 497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 484 aa  495  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 484 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  46.59 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 500 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 497 aa  435  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 499 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 495 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 478 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 485 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>