More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3418 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 499 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 497 aa  1041    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 500 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 490 aa  597  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  56.01 
 
 		 495 aa  597  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 499 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 495 aa  528  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 492 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 492 aa  498  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 484 aa  458  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 484 aa  362  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 487 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 488 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 476 aa  345  8e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 481 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 490 aa  343  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 481 aa  343  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 466 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 494 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 465 aa  343  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 465 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 486 aa  335  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 479 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 465 aa  335  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 475 aa  333  3e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 477 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 476 aa  329  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 465 aa  329  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 485 aa  328  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 466 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 465 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 468 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 472 aa  323  5e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6809  cysteinyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 495 aa  323  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 485 aa  323  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>