More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1698 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
481 aa  986    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  78.08 
 
 
481 aa  750    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 
497 aa  574  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 
484 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
481 aa  523  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
484 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
483 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
484 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
484 aa  495  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  48.69 
 
 
495 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
490 aa  456  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
497 aa  458  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
499 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
492 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
499 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
500 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
486 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
495 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
486 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
492 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
484 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
466 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
485 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
485 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
485 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
485 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
487 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
470 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
468 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
459 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
487 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
493 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
468 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
465 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
483 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
466 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
485 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
493 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
466 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
467 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
466 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
479 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43 
 
 
481 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
456 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
456 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
471 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
465 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
465 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
465 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
465 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
465 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
465 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
481 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
480 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
465 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
465 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
467 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
465 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
464 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
466 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
459 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
465 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
459 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
485 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
466 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
476 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
459 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
480 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
459 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
466 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
468 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
466 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
459 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
472 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
476 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
466 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
461 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
478 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
478 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
459 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
459 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
459 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43 
 
 
494 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
465 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
499 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
459 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  43 
 
 
474 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
459 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
459 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
466 aa  365  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
490 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
498 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
463 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>