More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00790 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  69.29 
 
 		 492 aa  717    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 495 aa  1031    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 		 492 aa  677    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 486 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 490 aa  614  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 497 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  48.48 
 
 		 495 aa  500  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 481 aa  458  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 483 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 456 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 460 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 461 aa  342  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 505 aa  340  5e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 470 aa  339  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 460 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 494 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 458 aa  335  7.999999999999999e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 487 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 461 aa  335  9e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 481 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 474 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 459 aa  333  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 459 aa  332  6e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 460 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 457 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 488 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 484 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 462 aa  329  6e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 460 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 460 aa  329  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 480 aa  326  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 456 aa  326  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 485 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 457 aa  325  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 485 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 461 aa  324  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 461 aa  323  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 459 aa  323  6e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 461 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>