More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0382 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 
476 aa  729    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  73.32 
 
 
476 aa  723    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
475 aa  962    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  71.64 
 
 
476 aa  710    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
479 aa  525  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
468 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
487 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
466 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
481 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
485 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
478 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
493 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
465 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
468 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
478 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
474 aa  419  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
500 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
484 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
478 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
493 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
479 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
470 aa  408  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
466 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
466 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
466 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  44 
 
 
457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
494 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
456 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
486 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
460 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
487 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
466 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
458 aa  402  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
460 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
465 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
460 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
459 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
470 aa  393  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
460 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
470 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
477 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
466 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
460 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
472 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
459 aa  395  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
485 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
460 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
469 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
472 aa  394  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
490 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
485 aa  395  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
460 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
493 aa  391  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
455 aa  391  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
462 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
485 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
465 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
459 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
469 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
460 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  39.68 
 
 
485 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
481 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
465 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
485 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
466 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
460 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
459 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
466 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
485 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
460 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
453 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
463 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
460 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
460 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
459 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
459 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
461 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
461 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
461 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
461 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
473 aa  384  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>