More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2198 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  68.27 
 
 		 481 aa  723    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  72.86 
 
 		 484 aa  765    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  72.23 
 
 		 483 aa  757    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  71.1 
 
 		 480 aa  742    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  70.25 
 
 		 484 aa  742    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 484 aa  1013    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  73.28 
 
 		 484 aa  767    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 497 aa  481  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 490 aa  481  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 497 aa  458  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 492 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  46.09 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 492 aa  438  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 480 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 500 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 459 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 465 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 478 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>