More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0485 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 486 aa  1016    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 495 aa  608  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 490 aa  598  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 492 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 492 aa  580  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 497 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 499 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  49.09 
 
 		 495 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 484 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 483 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 484 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 500 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 493 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 484 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 486 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 456 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 488 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 470 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 456 aa  339  5e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 481 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 485 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 465 aa  333  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 459 aa  332  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 493 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 475 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 460 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 487 aa  329  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 474 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 476 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 466 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 459 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 468 aa  325  8.000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  324  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  324  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  324  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  324  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  324  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  40.37 
 
 		 461 aa  324  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 448 aa  323  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 468 aa  323  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 466 aa  322  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 480 aa  322  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 459 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 476 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 460 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 480 aa  319  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 460 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 459 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 461 aa  319  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>