More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3324 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 461 aa  963    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 785 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 466 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  38.6 
 
 		 495 aa  365  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 476 aa  363  3e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 510 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 476 aa  362  8e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 484 aa  362  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 465 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 484 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 468 aa  352  7e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 497 aa  352  8.999999999999999e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 486 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 472 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 481 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 465 aa  350  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 472 aa  350  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 492 aa  350  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 468 aa  345  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 466 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 469 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 485 aa  339  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 470 aa  339  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 493 aa  335  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 499 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 470 aa  333  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 494 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 448 aa  333  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 459 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 490 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 475 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 459 aa  326  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 457 aa  325  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>