More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2381 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 493 aa  1018    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  69.48 
 
 		 527 aa  718    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 492 aa  382  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 480 aa  315  9e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 481 aa  312  6.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 785 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 484 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 484 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 485 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  38.76 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 466 aa  276  8e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 460 aa  276  9e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 485 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 497 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 466 aa  269  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 466 aa  269  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 470 aa  269  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 465 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 504 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 492 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 499 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 494 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 469 aa  264  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 474 aa  263  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 500 aa  263  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 461 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 460 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 459 aa  262  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 463 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 485 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 456 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 485 aa  261  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>